
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
设计可是
分析员与探讨近年来冰箱时期提升期限牛羊肉的密度、持混流式水轮机、质感度、散布铁纯度、ROS、脂质过钝化物、MDA、GSH和GPX4关卡来评诂肌肉群组织性细胞膜膜的铁伤亡情况。后果界面显示,冰箱时期提升期限后,牛羊肉的密度在第六天和第6天取得下跌;持水性能减小;茶汤颜色变深,失掉质感,鲜颜色改成暗颜色。还有就是,散布铁、几丁质酶氧和MDA的纯度取得增强,细胞膜膜凋亡率取得身高。 探析拜谱生物导入不一样保鲜时间段的全身背部肌肉土样的核胆固醇,进而开展SDS-PAGE浅析,核胆固醇条带在不一样時期生长平均且类似于(图1a)。会按照核核球淀粉酶在不一样土样中的表示现状,浅析发展统一组土样的中四位数靠近于统一级别(图1b),表示全身背部肌肉土样核胆固醇具备着保持良好的组内类似于性和组间不同之处性。 核营养物质组学共检测出1996种核营养物质。以B0为差表组,筛分B1、B2、B4和B6中的核淀粉酶酶使用地域一定的差异展示出方式概述,共检测到37九个DEPs。将火山图可视化效果,并通过FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两个人条件概述DEP。最后如图是1c-f展示出,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别检测出22、33、73和140个DEPs,进来分发型别上浮6、11、32和8九个,再降16、22、41和51个。聚类分析法措施鉴定了有所一定的差异保鲜冷库日期段肌肤企业中核营养物质的展示出方式,最后表示肌肤核淀粉酶酶展示出方式地域一定的差异伴随着店铺日期的提升而提升(图1g)。
图1| 不一样保温时候的健身肌肉打样定制蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种不同冷库准确时间的力量样板相互影响血清了解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁去世淀粉酶肽的PRM定量讲解讲解(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 基本概念KEGG丰度区别表达爱核蛋白的铁死忙共识机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT酶联免疫法核胆固醇组学技能类产品,拜谱微生物已研究开发来完成并设立了建立健全较为成熟的转录组学、核血清组学、新陈代谢组学或两组学合力类产品技能类产品装修标准,欢迎致电咨询!
参考资料资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.