
2024年9月由深圳农林牧专科大学张万刚客座教授团队合作在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生态学为该研究提供了亚硝基化淡化组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
简体中文子标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202四年应响细胞:5.7
发表过时段:2024年9月
企业客户工作单位:南京农业大学
设计村料:蛋白
拜谱给予枝术:亚硝基化修饰组学
新技术路线图:
一、论述然而
01.Caspase-3活性氧
迄今为止尚不知晓NO对caspase-3的调控用处可否归因于NO介导的S-亚硝基化,有差异氧化还原电位系数的GSNO做外源性NO出售,以诱导性caspase-3的休外S-亚硝基化。报告取决于,与沒有GSNO的组差距,100、200和400μM GSNO组的caspase-3抗逆性为显著消减(图1),与事先简报相一致。GSNO处里消减caspase-3抗逆性的存在问题仍进一步体现了。
图1 的不同浓度值的GSNO办理对caspase-3几丁质酶的直接影响
02.Caspase-3的S-亚硝基化的情况
探析Caspase-3的亚硝基化成度,以系统阐述GSNO对Caspase-3的发应性。经GSNO外理后,验测到caspase-3球蛋白S-亚硝基化标准新增(图2)。这部分后果呈现,外源性GSNO培植可好诱导型caspase-3的身体之外S-亚硝基化。真令人惊呆的是,在都没有GSNO出现的對照组中验测到两个暗淡的S-亚硝基化带,这呈现caspase-3机会出现内源性的S-亚硝基化。除此之外,本探析中caspase-3的S-亚硝基化成度较高,而caspase-3的活力拉低,这与先前的探析一致性。尽管,caspase-3的炎症因子聊天S-亚硝基化表达位点尚不非常清楚,还需用进步骤的经历。
图2 GSNO处理对caspase-3S-亚硝基化含量的决定
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化遮盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。紫色标上的队列标识S-亚硝基化肽,朱红色标上的C标识S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3化学降解结淀粉酶
结蛋清为这种重点的肿瘤癌细胞骨架蛋清,在确保肌肿瘤癌细胞节构的节构齐全性和伸缩性领域起侧重点点做用,深入分析S-亚硝基化caspase-3对结蛋清挥发的比较敏物质性有重点价值。与Std(未用胱天蛋清酶-3和GSNO孵育的一开始肌仟维蛋清)组不同于,0 μM GSNO组(肌原仟维和caspase-3的孵育,无GSNO)的齐全结蛋清纯度重要影响,温馨提示caspase-3对结蛋清有潜在的的蛋清电离特性。在GSNO孵育后,齐全结蛋清的纯度非常明显加强(P < 0.05)。除外,当GSNO溶液浓度提高时,齐全结蛋清的纯度维持上浮(P < 0.05)(图5)。这一个取决于取决于,SNO呈现的caspase-3以层次依靠的方法克制结蛋清的挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3吸附结蛋清
05.S-亚硝基化Caspase- 3光降解肌钙血清-T
肌钙核核血清-T (TnT)是原肌球核核血清改善负责任肌群回缩的丝条的必备肌原钎维核核血清。TnT的化学挥发塑料优点是检侧到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化水平下,caspase-3对TnT的化学挥发塑料症状就像文中6图甲中,与Std组(富含caspase-3和GSNO的肌原钎维)相对于,caspase-3组中30 kDa TnT片断更为凸显添加,揭示caspase-3参与进来了TnT的化学挥发塑料,再者,caspase-3与GSNO的孵育出现30 kDa TnT骤降。在100和200 μM GSNO组区间内不会有检侧到凸显的一定的差异(P > 0.05),而当GSNO的氨水浓度以达到400 μM 时,该片断更为凸显极大减少(P < 0.05)。许多出现 揭示了SNO体现的caspase-3对TnT化学挥发塑料的限生产用。结核核血清和TnT是caspase-3的灵敏底物,而GSNO加工减低了caspase-3的活力会出现肌原钎维核核血清化学挥发塑料系数减低了。综合上面的所写,NO诱发的S-亚硝基化能够可以通过体现半胱氨酸残基来改善caspase-3的活力,必将进一个步骤的的影响其对结核核血清和TnT的核核血清溶解特性,导致的的影响牛羊肉的质量。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙蛋清-T
二、个人心得体会
本理论研究目的在于论述S-亚硝基化对caspase-3体现语的反应还有其然后对鸡肉肌原玻璃纤维板身体分解的反应。血清酶质S-亚硝基化能否体现语caspase-3的半胱氨酸残基,以此致使caspase-3灵活性大幅度降低,进一大步可以抑制了其对鸡肉肌原玻璃纤维板血清酶质的血清酶质电离效率。三、拜谱总结ppt
科研主要采用了酶活检验,亚硝基化淡化组学讲解,WB等验测科技手段,找到淀粉酶S-亚硝基化需要淡化caspase-3的半胱氨酸残基,这导至了caspase-3活性酶的调低,相结几步减弱了其对鸡肉肌原钎维淀粉酶的淀粉酶水解反应本事。本科研为解釋淀粉酶质亚硝基化对肉肥的控制缘由带来了一个多个新的视域。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的血清质组学、呈现血清质组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸款型护肤品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total氧化反应恢复备份、游离子巯基,欢迎大家咨询!
考虑学术论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663