代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
有效生物学物质评定：排泄组学新系统也能否对西药方中的生物学上的有效生物学物质展开全方位剖析，评定出草药中的吸附性有效生物学物质。这类，合理利用由于质谱（MS）的排泄组学新系统，能否评定出长白山长白山人参中的长白山长白山人参皂苷等吸附性有效生物学物质。此类新系统还能否界定西药和非西药有些的生物学上的标示物，为西药方的质调节提供了保证。
产品高质管理：按照分泌率组学水平，还会对中要茶的产品高质去监测和控制。如，能够草木分泌率组学分享，还会开放共性类痛风性膝风湿病的中要茶组分的产品高质标记图片的参考值的方法。前者，分泌率组学还还会快速精确中要茶中的毒副作用组分以至于毒副作用管理机制，如按照UPLC-Q-TOF-MS研究方案，分辨有所差异乌头草木的化学式组分，并快速精确更具止痛抗逆性和呼吸功能衰竭毒副作用的菌物碱。
2. 中药药效机制研究
功效靶点快速精确：代谢率组学技術可不可以有助于快速精确中药方渗透性的成分的团伙靶点。譬如，研发显示雷公藤红素可凭借调低Treg/TH1和Treg/Th17平稳、抑制NF-κB通道等管理机制树立消除炎症功效。
功能工作策略加以分享：分解组学技能够表明中草药配方缓解发病的功能工作策略。列举，探究挖掘青蒿素耐药性与疟原虫的线粒体分解变动有关，非靶向疗法分解组学表明了与该期间涉及到的的分解物发生改变。另外，分解组学还就可以按照分享分解物的发生改变，探究中草药配方复方的功能工作策略。
3. 中药安全性评价
渗透性机理研发：排泄组学技术设备能够主要用于研发中要的渗透性机理。列举，可以通过排泄组学和16S rDNA测序的融合定量分析，论述了清益汤对危重症急慢性胰腺炎关于急慢性肺问题的维护机理，并判断了铁沉稳、地域差异排泄物和菌群制品菌群中间的直接关系。
的可靠性考评：代谢率组学高技术还能于中医材的的可靠性考评，自动识别意向的毒素营养成分和毒素靶点，进而为中医材的的很安全的便用保证学科法律规定。
4. 中医证候研究
证候对应细胞分泌物进行分析：细胞分泌组学工艺就可以于表现与中醫证候对应的内源性细胞分泌物转变 ，捕助中醫证候的判断和诊治。比如，能够细胞分泌组学研究方案，已在冠烦扰之处求美者中亲子鉴定出与痰瘀证主气阴两虚证对应的海洋生物标记物。
证候预防探讨研究：制造转化组学科技还应该于探讨研究中医医生对中医医生证候的预防效率。举个例子，使用制造转化组学科技及聚类研究法研究法，看见“黄芪-茯苓-泽泻”等绑定抗癫痫类药加装音响适于肾病总体征的新组方抗癫痫类药，会对多样肾病总体征关于的生物制品标志logo物制造的影响。
5. 多组学技术整合应用
几组学梳理：分解代谢组学与相关组学方法（如dna组学、转录组学、蛋清质组学等）的梳理用，为中西药研发提高一个多向度的研究架构设计。种梳理用仅仅深入了自己对中西药化学物资在团伙要素上对身体生理学和方面的问题心态的关系，有时为揭露中西药的效用制度和药性物资基本条件提高了强坚实的方法。
发病控制管理新机制：几组学技巧可能广泛用于研发中药方控制发病的大分子管理新机制。如，在蛋清质组学和产生组学的联席技术应用，阐述了与中醫各类的膝盖骨软骨骨性骨关节软骨炎紧密对应的不一致性抒发蛋清和产生径路。
代谢转化组学科技在中西药分析中的运用，为中西药的近代化和正确整形作为了比较重要的科学技术鼓励，不利于促使中西药的的规范化的和新现代化提升。