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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一种对于化工机械成分而被耳熟能详的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“基础代谢固体废物”为“产品小分子结构”的艰辛之路类似于,有一天近10多长时间才被发掘其核心的怪物学模块,再也“侧睡农奴把大合唱”,相当是在免疫细胞真菌感染性皮肤急病设计域内异军突起。已经多页医学论文消息了在几种真菌感染性皮肤急病的食草动物型号中提供衣康酸或其电化学装饰衍怪物的根治益处,消息队列掘其内在靶点。更多衣康酸的“下一世”与“今生今世”,具体情况见微信推文《乳酸的学渣逆袭弟兄——衣康酸!文中陪我熟知衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸呈现淀粉酶组学产品,实现1000+玄妙度遮盖位点排除,安全再次出现径典靶点,全地方生信定性分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“知道”到“检验”全具体步骤的服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验操作方案

02、测试统计数据统计数据

03、经“点”再次出现

在监测数剧中,排除好几个论文资料中新闻稿的典型靶点另外 其衣康酸体现位点,如首个被发现了的衣康酸共价体现蛋清KEAP1,另外 糖酵解径路中的3个至关重要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或炎性小体组成的蛋清NLRP3和体细胞死亡的过程中的至关重要蛋清RIPK3等,其质谱图如下随时图随时。

04、服务特别

1.丰富质控

商家化炎症因子朋友探头孵育、SDS-PAGE判断、WB核验、子样本涉及到的性讲解等各位子判断,确保创业项目然而可信性。

2.高特点质谱器材工作平台

在Orbitrap Astral全下一代人高辨别质谱仪金刚萨垛下,满足衣康碱化遮盖位点及蛋白酶亲子鉴定新深浅,力助科学合理调查新会发现。

3.全步奏一坐式服务的

依据拜谱生物体加强制度建设的进行实验系统,可提拱“癌细胞培养教育→电极孵育→WB的检查测量→艰深度衣康过酸表达的检查测量→特权生信分折→特殊位点PRM确认”全方案业务,省时实惠呢更实惠。

05、分析一下信息(一些)

06、app方向上

PART 2、论文资料分析

文献资料一

国外英文子标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名字副标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

研发玩法:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文二

英文音标题头:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

汉语小标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

学习内部:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、典型案例延伸想法

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备着具有的底物构建作用,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱海洋生物衣康酸性反应淡化组监测数据库中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸淡化(下列图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

当做TCA循环法中的其中排泄物,衣康酸改善排泄、天然抗体细胞和支原体感染中的相互间使用,为手术治疗方法天然抗体细胞支原体感染性患病供应了重复使用手术治疗方法营销策略。衣康酸组成部分中的亲电性α,β-不饱和点羧酸组成部分能对球胆固醇质含量上的催化活性半胱氨酸残基来烷基化掩盖(迈克尔加持化学反应),上述译文资料后掩盖被被称作“衣康酸掩盖(itaconation)”,从根本上不良影响球胆固醇质含量技能,宏观调控天然抗体细胞回话和排泄路径,为许多患病药物治疗技术创新供应新策略。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用体现血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物药学可以说 一定量靶向治疗分解代谢组(QMT1000)或激光能量排泄靶向疗法排泄组品牌对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考价值专著

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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